Non solo per una questione di PageRank che, a meno che non sono cambiate le cose da questo punto di vista, è passabile con un link ad un normale dominio di terzo livello; un dominio di terzo livello ha a mio avviso meno probabilità di essere backlinkato rispetto ad una pagina interna di un sito; ripeto ancora a mio avviso. Inoltre credo che la forza del sito madre venga ereditata più facilmente da una cartella interna. E' anche una questione logica: se valgo "posso rischiare più facilmente" di includere una risorsa valida. Se mi svincolo usando un dominio di terzo livello rischio un pò meno di compromettermi se la risorsa non è valida.

Poi è anche una questione di personale preferenza non so ;